После событий первой части Грю действительно оставил путь злодея. Теперь он занят производством мармеладок и, что важнее, воспитынием трёх приёмных дочерей. Его мирная новая жизнь рушится, когда тайная арктическая лаборатория, где разрабатывали опасное оружие, оказывается похищенной. Мировая безопасность под угрозой, и единственный, кто может помочь — это сам Грю, несмотря на его прошлое.
В африканских равнинах наступает страшная засуха, и стадо зебр, ища виновного, обращает взор на Кумбу — необычного детёныша, родившегося без части полос. Считая его источником несчастий, сородичи изгоняют его, а отец отворачивается. Оставшись один на один с суровой природой, отважная, но наивная зебра начинает невероятное путешествие, чтобы найти магические воды, способные вернуть ему...