Третья и заключительная часть трилогии «Бегущий в лабиринте» продолжает историю Томаса и его товарищей, которые после побега из лабиринта оказались в мире, не менее опасном и загадочный. Теперь они вынуждены столкнуться с истинным злом — могущественной организацией ПОРОК (WCKD), которая стоит за всеми испытаниями.
Взрослая Элиза Рэйнер, известный эксперт по паранормальным явлениям, получает загадочный запрос о помощи от мужчины, который уверен, что его дом одолели призраки. Место, куда её приглашают, оказывается знакомым до боли — это тот самый дом, где прошло её трагическое детство. Воспоминания о жестоком отце, который запирал её в тёмном подвале, считая выдумками истории о потустороннем, настигают её...