Фильм «Чёрные воды» — это напряжённый психологический триллер с элементами боевика и драмы, действие которого разворачивается в изолированном месте. Главный герой, агент Скот Уилер, посвятивший себя служению государству, внезапно теряет сознание и приходит в себя в камере таинственной морской тюрьмы.
Америка, которую оставил Гэбриэл Драммер, исчезла. Вместо привычного дома — руины, вместо закона — право сильного. Кампания в Афганистане, закончившаяся катастрофой, стала лишь прелюдией к новой, куда более личной войне. Теперь ему предстоит сражаться не с внешним врагом, а с бездушным механизмом нового общества, раздираемого насилием и отчаянием.