Фильм переносит зрителя в мрачный и изолированный город Апачи-Джанкшен, расположенный на границе США и Таиланда, который стал прибежищем для преступников, контрабандистов и безжалостных убийц. Сюда, под предлогом написания статьи, прибывает амбициозная журналистка Аннабель, стремящаяся раскрыть тёмные секреты этого места.
Фильм «Район №9» предлагает радикально новый взгляд на контакт с внеземным разумом. Вместо грандиозного вторжения или технологического прорыва зритель сталкивается с громоздкой, будничной проблемой: десятки тысяч инопланетных беженцев, чей корабль-ковчег беспомощно застрял над Южно-Африканской Республикой.