Действие картины переносит зрителя в мрачную эпоху позднего Средневековья, когда на Пиренейском полуострове католическая Инквизиция, под руководством безжалостного Томáса де Торквемады, устанавливает режим всеобщего террора. Под предлогом борьбы с ересью и колдовством система пыток и публичных казней превращается в инструмент тотального контроля.
В 1327 году, в мрачных залах богатого бенедиктинского монастыря на севере Италии, разворачивается история, где вера сталкивается с разумом, а тайна — со смертью. Молодого и наивного послушника Адсо von Baskerville вверяют наставление опытному францисканскому монаху Вильяму Баскервильскому, известному своим острым умом и навыками логического анализа.