После того как гениальный старшеклассник-детектив Синъити Кудо стал жертвой нападения тайной преступной группировки «Черный Синдикат» и принял experimentalную ядовитую пилюлю, его тело обратилось в семилетнего ребёнка. Спасённый другом-учёным профессором Агасой, он берёт псевдоним Эдогава Конан и переезжает жить в семью своих друзей детства — Ран Мори и её отца, бывшего полицейского Когоро.
