Действие ленты разворачивается спустя год после масштабной битвы Годзиллы с Механической Годзиллой, когда человечество уже начало считать, что наконец-то избавилось от угрозы древних чудовищ и может вернуться к спокойной жизни. Но надежды оказываются преждевременными: легендарная Мотра, вечная соперница Годзиллы, отправляет человечеству жесткое требование вернуть в глубины океана абсолютно все...
