Действие разворачивается на Дальнем Востоке России, где переплетаются интересы спецслужб и организованной преступности. Агент южнокорейской разведки Чо, ранее потерявший информаторшу, получает новое задание — внедриться в сеть, занимающуюся незаконной переправкой людей и наркотиков через порт Владивостока.
Фильм «Харбин» переносит зрителя в напряжённую атмосферу начала XX века, в период японской оккупации Кореи. История вращается вокруг Ан Джун-гына — командира подразделения корейских борцов за освобождение. В конце 1908 года, совершив акт гуманизма по отношению к вражескому майору, он неожиданно для себя обрекает свой отряд на верную гибель.