Глубоководные взрывы у полярной исследовательской станции будит древнее чудовище. На русский атомный подводный крейсер, выполняя секретную миссию, нападает кракен — гигантский и невероятно агрессивный осьминог. Субмарина исчезает в ледяных пучинах, оставив после себя лишь вопросы и тревогу. На поиски отправляется новая команда под командованием капитана Виктора Воронина.
Сериал «СМЕРШ. Продолжение» переносит зрителя в напряжённую атмосферу послевоенного времени, где личный подвиг и государственная необходимость часто вступают в конфликт. Контрразведка под руководством опытного капитана Павла Семенова и майора госбезопасности Алексея Ермакова сталкивается с новой, изощрённой угрозой — сетью немецких агентов, действующих на территории страны.