Подводная лодка ВМС США находит на дне океана огромный металлический корабль, явно не земного происхождения. Для его изучения создают специальную подводную лабораторию «Нексус», куда стягивают ведущих специалистов: психолога-математика Нормана Гудмэна, биолога Элизабет Гальперин, астрофизика Гарри Эдамса и других.
В третьей части оригинальной киносаги о Тёмном рыцаре Бэтмен (Вал Килмер) вынужден противостоять не одному, а двум коварным врагам, объединившим силы для уничтожения Готэма. Бывший окружной прокурор Харви Дент, обезображенный кислотой и ставший безумным Двуликим (Томми Ли Джонс), стремится стереть с лица земли всё, что напоминает ему о прошлом.