Тринадцатилетний Порфирасу «Порфи» Патагос всю жизнь провёл в тихой деревне Симитра, мечтая со временем управлять маленькой заправкой, которую построил его отец. Но сильное землетрясение уничтожает его мир: погибают родители, а младшая сестра Мина таинственно исчезает. Оставшись один, Порфи понимает, что сестра — его последняя связь с прошлым, и решает отправиться на её поиски.
Мир «Клеймор» — это мрачное альтернативное средневековье, где человеческие поселки постоянно подвергаются нападениям чудовищных оборотней, известных как ёма. Эти существа, способные принимать облик людей и поедающие их плоть, становятся ещё опаснее, после того как съедают мозг жертвы, заимствуя её воспоминания и опыт.