Действие разворачивается в разрушенном мире Спайра — городе, парящем над руинами цивилизации, где техника соседствует с магией, а богатые жители Ирода живут в небесных небоскрёбах, в то время как простолюдины влачат существование в мрачных подвалах. Главная героиня, Алита, пробуждается как киборг без воспоминаний, но с reflexes элитного бойца.
Действие разворачивается в стенах ООН в Нью-Йорке, где работает Сильвия Брум, опытный синхронный переводчик. Её мир, состоящий из точных формулировок и дипломатических тонкостей, рушится в один мист, когда она случайно подслушивает разговор двух мужчин на диалекте одного из африканских языков. В их беседе сквозит угроза, и Сильвия с ужасом понимает: речь идёт о запланированном убийстве главы...