Действие разворачивается в Иокогаме 1879 года. Химеда Кэнсин, известный в прошлом как безжалостный убийца, уже несколько лет пытается жить мирной жизнью, защищая слабых и отказавшись от своего кровавого прошлого. Он строит скромное счастье с Каору, но тень прошлого оказывается неотступной. На горизонте появляется Энъиси, младший брат Томэ, жены Кэнсина, погибшей много лет назад.
Фильм «Бродяга Кэнсин: Великий киотский пожар» продолжает эпическую сагу о Химуре Кэнсине, человеке, пережившем гражданскую войну и поклявшемся никогда не убивать. Его клятва оказывается под угрозой, когда на горизонте появляется Макото Сисио — харизматичный и безжалостный идеолог, возглавляющий радикальное движение.
Заключительная часть трилогии, завершающая историю легендарного самурая Химуры Кэнсина. Действие переносит нас в Киото, где возникает новая угроза — Макато Сишио, хладнокровный и безжалостный ассасин, стремящийся свергнуть правительство и захватить власть. Его идеология и сила ставят под вопрос все, за что боролся Кэнсин, превратившийся из убийцы в защитника слабых.