Фильм «В списках не значился» переносит зрителя в самый первый день Великой Отечественной войны — 22 июня 1941 года. Главный герой, молодой лейтенант Николай Плужников, полон надежд и отправляется в Брестскую крепость по полученному назначению. Ошеломлённый суетой вокзала и потоком эвакуирующихся, он спешит к месту службы, но бюрократические процедуры затягиваются.
Аня сбежала от авторитарных родителей в Москву, чтобы доказать: она может быть успешна сама по себе. Дима, наоборот, застрял в родительской квартире, где его личная жизнь задавлена странностями отца и матери. Их миры — антиподы. Но одна случайная ночь и шокирующее известие о беременности ломают все планы.