Третья и заключительная часть трилогии «Бегущий в лабиринте» продолжает историю Томаса и его товарищей, которые после побега из лабиринта оказались в мире, не менее опасном и загадочный. Теперь они вынуждены столкнуться с истинным злом — могущественной организацией ПОРОК (WCKD), которая стоит за всеми испытаниями.
Фильм переносит в самое сердце одной из самых изматывающих кампаний XX века — войны во Вьетнаме. История фокусируется на группе добровольцев — «тunnel rats» (крысы-тоннельные), чья задача проникнуть в запутанную сеть подземных ходов, созданных Вьетконгом. Эти узкие, темные проходы превращены в настоящие ловушки: мины, ловушки-гранаты и невидимые враги, скрывающиеся в темноте.
Действие разворачивается на изолированном тропическом острове, который с первого взгляда кажется райским уголком, но скрывает мрачную тайну. Бывший морской пехотинец Джек Карвер, по воле случая оказавшись здесь, быстро понимает, что этот кусок земли — не просто дикая природа, а высокотехнологичный полигон для жестоких экспериментов.