Фильм «Капитан Волконогов бежал» — это напряжённая драма-триллер, действие которой разворачивается в 1938 году в Ленинграде, в разгар сталинских репрессий. Главный герой, капитан Фёдор Волконогов, hitherto успешный и преданный сотрудник органов, неожиданно для самого себя оказывается в положении преследуемого.
В самарской квартире остаётся одна хозяйка — школьница Настя, которая вместе с бабушкой отправляется в Санкт-Петербург. В передряги попадают её верные компаньоны: добрый и немного наивный пёс Пират и его подруга, умная и практичная собака Йоко. Оставленные в специализированном отеле для животных, они воспринимают это как высшую степень предательства и решают вернуться домой самостоятельно.
Россия, начало двадцатого века. Казалось бы, две безупречные семьи живут в своей уютной реальности, не подозревая, что под спокойной поверхностью бурлит темная сила. Эту силу воплощает Иоган — таинственный владелец фотостудии, чьё подвальное помещение превращено в странный «фотографический театр Маркиза де Сада».