После возвращения домой команда «Энтерпрайза» сталкивается с беспрецедентным кризисом: сама организация, которую они служат, оказалась скомпрометирована изнутри. Необъяснимые террористические акты и бездействие командования погружают галактику в хаос, а главный противник остаётся неуязвимым и невидимым.
Лето 1979 года в провинциальном городке идет съемка любительского фильма на камеру «Супер 8». Группа юных кинолюбителей, увлеченных процессом, случайно оказывается на месте масштабной железнодорожной катастрофы. Их камера фиксирует не только сам взрыв и разрушения, но и странные детали, которые не вписываются в версию о простой аварии.
Фильм 2009 года знаменует собой яркий перезапуск культовой космической оперы, возвращая зрителей к истокам легенды. Сюжет разворачивается вокруг Ромуланца по имени Нерон, который, прибыв из альтернативного будущего, намерен уничтожить планету Вулкан и всеми силами противостоять основам Объединенной федерации планет. Его мотив — личная месть, ставшая экзистенциальной угрозой для цивилизации.
После ухода из ЦРУ Итан Хант пытается начать новую жизнь, готовя следующее поколение агентов и планируя женитьбу. Однако спокойствие длится недолго — его бывшая ученица Линдси Феррис похищена, а её похитителем оказывается Оуэн Дэвиан, хладнокровный и изощрённый торговец оружием, продающий технологии смертельного уровня.