Действие разворачивается в годы Великой Отечественной войны, в порту, захваченном немецкими войсками и превращённом в укреплённую базу. Несмотря на чёткий порядок и жестокие репрессии, установленные комендантом — опытным и беспощадным военачальником Рейнхардтом, — порт постоянно потрясают точечные взрывы: гибнут военные корабли, танкеры с горючим, суда с продовольствием.
Снятый в 1944 году, в разгар Великой Отечественной войны, фильм «Зоя» обращается к реальной, ещё свежей в памяти соотечественников, биографии Зои Космодемьянской — девушки, добровольно ставшей партизанкой и казнённой нацистами. Картина не стремится к масштабным батальным сценам, а фокусируется на личной драме, нравственном выборе и невероятной стойкости главной героини.