Сериал «Императрица» переносит зрителя в середину XIX века, в блестящий, но безжалостный мир Габсбургской империи. Главная героиня — семнадцатилетняя Елизавета (Сиси) из баварского дома Виттельсбахов, чья свободолюбивая натура и неприятие строгих этикетов сразу ставят её в конфликт с новой реальностью.
Германия 1990-х, только что стёртая граница между Востоком и Западом. В угасающем пограничном городке, застывшем во времени, начинают исчезать девушки. На место преступления присылают напарников, чьи миры никогда не должны были пересечься: Маркуса, бывшего следователя Штази, грубого и практичного восточного полицейского, и Патрика, интеллектуала-комиссара из Гамбурга.
Кати живёт размеренной жизнью в Гамбурге, пока в один день взрыв не разрушает всё — погибают её муж и маленький сын. Полиция быстро находит подозреваемых, связанных с националистическим движением, но Кати сомневается в официальной версии. Она начинает собственное расследование, погружаясь в тёмный мир радикалов и сталкиваясь с безразличием системы.